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第４０話　シャアの逆襲

クエストデモ：無し。
会話イベント：アムロとシャアが戦闘。

アムロたちは味方本拠地まで後退させる。敵は味方本拠地を集中攻撃してくるので待ち構えて撃破する。敵の数が圧倒的に多いので、１機１機を相手にする余裕は無い。
敵の部隊がＭＡＰ移動してユニットを展開したら、母艦を集中攻撃して撃墜する。その時に、ゲストのジェガンでガンガン攻撃して戦艦のＨＰを削ってもらうのと同時に、可哀想だがそのジェガンたちにも撃墜されてもらう。とにかく敵数が多いので、ガーターの攻撃なども利用して効率良く敵戦艦たちを撃墜していこう。
ギュネイのヤクト・ドーガとシャアのサザビーには、アムロのリガズィでは対抗できないので、オリジナル隊のＮＴ部隊で戦う。
最後は、敵戦艦を１機だけ残して泳がせておき、コロニーの占領、経験値稼ぎ、ジェガンが撃墜されたゲストの戦艦を使っての回収、を行う。経験値稼ぎは、まだ開発が残っているユニットだけに留め、それ以外の敵ユニットは全て回収しておこう。
最終段階に設計できるユニットは高額なので、多くの資金が必要となる。